AMCC memiliki struktur organisasi seperti Pengurus Harian, Departemen (HUMAS, PSDM, IT, KWU, KOMVIS, KRT) dan Divisi
Departemen yang bertugas dalam koordinasi, pengawasan, serta evaluasi terkait keberjalanan program kerja dan kinerja dalam masa kepengurusan UKM AMCC Universitas Amikom Yogyakarta
Departemen yang mengelola pelatihan dan sebagai pengontrol Sumber Daya Manusia untuk pengurus dan member UKM AMCC Universitas Amikom Yogyakarta
Menjalin hubungan kerja sama dengan pihak lain baik dalam maupun luar UKM AMCC Universitas Amikom Yogyakarta
Bertugas melakukan riset atau penelitian tentang IT yang bisa dilakukan dengan mengajak member untuk melakukan riset bersama
Bertanggungjawab dalam pengelolaan konten baik itu dalam bentuk publikasi, dekorasi, dan dokumentasi di UKM AMCC Universitas Amikom Yogyakarta
Merintis dan mengelola usaha di AMCC di bawah pengawasan UKM AMCC Universitas Amikom Yogyakarta
Bertanggungjawab menjaga inventaris UKM AMCC Universitas Amikom Yogyakarta
Bertugas mengelola dan mengembangkan divisi pelatihan yang ada di UKM AMCC Universitas Amikom Yogyakarta